磁灸治疗一般没有危害，磁灸治疗时可能出现头昏、乏力、心悸、恶心、皮疹等不良反应，但是只要停止治疗，这些反应就会自行消失，不会留下任何后遗症。
磁灸也就是磁疗，是利用人造磁场施加于人体经络、穴位和病变部位治疗某些疾病的方法。它通过磁场激活免疫机制，并通过酶的作用影响酶的活性，从而影响这些酶参与的代谢反应，同时产生的热能可以影响分子的结构和化学性质，影响酶的活性和降解产物，并影响沿着神经末梢和分泌平面轴突的膜细胞的功能。因此，磁灸是一种集热疗、磁疗和按摩于一体的综合性自然理疗方法。现在很多的医院也有专门进行磁疗的设备，对于头痛、冠心病、高血压、关节炎、失眠、胃肠炎、面肌痉挛，以及扭挫伤、颈椎病等都有很好的效果，随着时间的推移，这种疗法逐渐的被人们所接受。
